Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APODP05090 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APODP05090 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APODP05090 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APODP05090 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APODP05090 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APODP05090 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APODP05090 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APODP05090 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APODP05090 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APODP05090 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APODP05090 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APODP05090 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APODP05090 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APODP05090 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APODP05090 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APODP05090 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APODP05090 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APODP05090 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APODP05090 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APODP05090 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APODP05090 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APODP05090 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APODP05090 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APODP05090 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APODP05090 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APODP05090 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APODP05090 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APODP05090 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APODP05090 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APODP05090 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APODP05090 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APODP05090 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APODP05090 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APODP05090 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APODP05090 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APODP05090 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APODP05090 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APODP05090 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APODP05090 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APODP05090 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APODP05090 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APODP05090 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APODP05090 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APODP05090 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APODP05090 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APODP05090 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APODP05090 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APODP05090 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APODP05090 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APODP05090 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APODP05090 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APODP05090 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APODP05090 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APODP05090 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APODP05090 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APODP05090 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APODP05090 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APODP05090 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APODP05090 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APODP05090 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APODP05090 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APODP05090 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APODP05090 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APODP05090 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APODP05090 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APODP05090 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APODP05090 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APODP05090 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APODP05090 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
APODP05090 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
APODP05090 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APODP05090 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APODP05090 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APODP05090 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APODP05090 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APODP05090 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APODP05090 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APODP05090 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APODP05090 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APODP05090 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APODP05090 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APODP05090 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APODP05090 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APODP05090 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APODP05090 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APODP05090 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APODP05090 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
APODP05090 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APODP05090 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APODP05090 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APODP05090 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APODP05090 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APODP05090 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APODP05090 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APODP05090 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APODP05090 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APODP05090 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APODP05090 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APODP05090 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms