Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFNB1P01574 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms