Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms