Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
POP4O95707 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POP4O95707 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POP4O95707 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
POP4O95707 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POP4O95707 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POP4O95707 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POP4O95707 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POP4O95707 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POP4O95707 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POP4O95707 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POP4O95707 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POP4O95707 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POP4O95707 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POP4O95707 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POP4O95707 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POP4O95707 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POP4O95707 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POP4O95707 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POP4O95707 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POP4O95707 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POP4O95707 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POP4O95707 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POP4O95707 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
POP4O95707 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POP4O95707 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POP4O95707 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
POP4O95707 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
POP4O95707 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POP4O95707 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POP4O95707 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
POP4O95707 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POP4O95707 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POP4O95707 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
POP4O95707 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
POP4O95707 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
POP4O95707 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POP4O95707 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POP4O95707 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POP4O95707 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POP4O95707 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POP4O95707 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POP4O95707 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POP4O95707 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POP4O95707 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POP4O95707 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POP4O95707 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POP4O95707 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
POP4O95707 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POP4O95707 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POP4O95707 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POP4O95707 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POP4O95707 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POP4O95707 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
POP4O95707 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
POP4O95707 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
POP4O95707 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
POP4O95707 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
POP4O95707 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POP4O95707 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POP4O95707 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POP4O95707 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POP4O95707 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POP4O95707 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POP4O95707 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POP4O95707 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POP4O95707 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POP4O95707 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POP4O95707 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POP4O95707 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POP4O95707 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POP4O95707 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
POP4O95707 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POP4O95707 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POP4O95707 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POP4O95707 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POP4O95707 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POP4O95707 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
POP4O95707 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POP4O95707 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POP4O95707 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
POP4O95707 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POP4O95707 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POP4O95707 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POP4O95707 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POP4O95707 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POP4O95707 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
POP4O95707 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POP4O95707 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POP4O95707 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POP4O95707 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POP4O95707 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POP4O95707 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POP4O95707 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POP4O95707 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POP4O95707 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POP4O95707 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POP4O95707 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POP4O95707 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POP4O95707 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms