Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX3O95343 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX3O95343 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX3O95343 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX3O95343 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX3O95343 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX3O95343 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX3O95343 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX3O95343 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX3O95343 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX3O95343 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX3O95343 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX3O95343 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX3O95343 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX3O95343 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX3O95343 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX3O95343 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX3O95343 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX3O95343 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX3O95343 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX3O95343 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX3O95343 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX3O95343 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX3O95343 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX3O95343 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX3O95343 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX3O95343 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX3O95343 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX3O95343 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX3O95343 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX3O95343 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX3O95343 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX3O95343 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX3O95343 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX3O95343 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX3O95343 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX3O95343 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX3O95343 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX3O95343 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX3O95343 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX3O95343 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX3O95343 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX3O95343 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX3O95343 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX3O95343 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX3O95343 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX3O95343 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX3O95343 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms