Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPBO95292 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPBO95292 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPBO95292 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPBO95292 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPBO95292 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPBO95292 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPBO95292 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPBO95292 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPBO95292 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPBO95292 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPBO95292 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPBO95292 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPBO95292 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPBO95292 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPBO95292 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPBO95292 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPBO95292 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPBO95292 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPBO95292 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPBO95292 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPBO95292 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPBO95292 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPBO95292 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPBO95292 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPBO95292 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPBO95292 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPBO95292 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPBO95292 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPBO95292 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPBO95292 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPBO95292 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPBO95292 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPBO95292 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPBO95292 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPBO95292 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPBO95292 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPBO95292 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPBO95292 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPBO95292 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPBO95292 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPBO95292 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPBO95292 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPBO95292 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPBO95292 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPBO95292 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPBO95292 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPBO95292 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPBO95292 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPBO95292 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPBO95292 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPBO95292 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPBO95292 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPBO95292 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPBO95292 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPBO95292 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPBO95292 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPBO95292 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPBO95292 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPBO95292 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPBO95292 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPBO95292 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPBO95292 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPBO95292 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPBO95292 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPBO95292 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPBO95292 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPBO95292 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPBO95292 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPBO95292 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPBO95292 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPBO95292 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPBO95292 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPBO95292 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPBO95292 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPBO95292 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPBO95292 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPBO95292 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPBO95292 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPBO95292 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPBO95292 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPBO95292 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPBO95292 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPBO95292 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPBO95292 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPBO95292 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPBO95292 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPBO95292 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPBO95292 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPBO95292 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPBO95292 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPBO95292 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPBO95292 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPBO95292 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPBO95292 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPBO95292 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPBO95292 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPBO95292 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPBO95292 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPBO95292 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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