Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCN2BO60939 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCN2BO60939 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCN2BO60939 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCN2BO60939 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SCN2BO60939 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCN2BO60939 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCN2BO60939 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCN2BO60939 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SCN2BO60939 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCN2BO60939 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCN2BO60939 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCN2BO60939 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCN2BO60939 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SCN2BO60939 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCN2BO60939 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCN2BO60939 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SCN2BO60939 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SCN2BO60939 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCN2BO60939 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCN2BO60939 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SCN2BO60939 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SCN2BO60939 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCN2BO60939 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SCN2BO60939 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SCN2BO60939 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SCN2BO60939 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCN2BO60939 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCN2BO60939 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCN2BO60939 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCN2BO60939 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCN2BO60939 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCN2BO60939 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCN2BO60939 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCN2BO60939 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCN2BO60939 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCN2BO60939 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCN2BO60939 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCN2BO60939 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCN2BO60939 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCN2BO60939 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCN2BO60939 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCN2BO60939 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCN2BO60939 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCN2BO60939 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SCN2BO60939 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SCN2BO60939 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCN2BO60939 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCN2BO60939 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCN2BO60939 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCN2BO60939 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCN2BO60939 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCN2BO60939 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SCN2BO60939 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCN2BO60939 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCN2BO60939 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SCN2BO60939 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCN2BO60939 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SCN2BO60939 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCN2BO60939 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCN2BO60939 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SCN2BO60939 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
SCN2BO60939 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCN2BO60939 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCN2BO60939 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SCN2BO60939 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SCN2BO60939 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
SCN2BO60939 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCN2BO60939 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SCN2BO60939 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
SCN2BO60939 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SCN2BO60939 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SCN2BO60939 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SCN2BO60939 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCN2BO60939 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms