Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CREB3O43889 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CREB3O43889 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CREB3O43889 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CREB3O43889 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CREB3O43889 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CREB3O43889 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CREB3O43889 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CREB3O43889 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CREB3O43889 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CREB3O43889 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CREB3O43889 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CREB3O43889 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CREB3O43889 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CREB3O43889 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB3O43889 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB3O43889 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB3O43889 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB3O43889 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB3O43889 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB3O43889 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB3O43889 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB3O43889 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB3O43889 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB3O43889 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB3O43889 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB3O43889 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB3O43889 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB3O43889 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB3O43889 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB3O43889 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB3O43889 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB3O43889 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB3O43889 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB3O43889 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB3O43889 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB3O43889 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB3O43889 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB3O43889 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB3O43889 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB3O43889 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB3O43889 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB3O43889 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB3O43889 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB3O43889 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB3O43889 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB3O43889 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB3O43889 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB3O43889 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB3O43889 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB3O43889 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB3O43889 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB3O43889 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB3O43889 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB3O43889 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB3O43889 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB3O43889 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB3O43889 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB3O43889 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB3O43889 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB3O43889 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB3O43889 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB3O43889 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB3O43889 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB3O43889 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB3O43889 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB3O43889 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB3O43889 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB3O43889 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB3O43889 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB3O43889 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB3O43889 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB3O43889 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB3O43889 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB3O43889 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB3O43889 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB3O43889 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB3O43889 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB3O43889 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB3O43889 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB3O43889 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB3O43889 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB3O43889 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB3O43889 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB3O43889 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB3O43889 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB3O43889 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB3O43889 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB3O43889 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB3O43889 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB3O43889 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB3O43889 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB3O43889 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB3O43889 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB3O43889 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB3O43889 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB3O43889 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB3O43889 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB3O43889 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB3O43889 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms