Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms