Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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