Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms