Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
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