Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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C4orf47A7E2U8 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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C4orf47A7E2U8 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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C4orf47A7E2U8 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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C4orf47A7E2U8 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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C4orf47A7E2U8 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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C4orf47A7E2U8 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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C4orf47A7E2U8 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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