Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
A6NL46 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A6NL46 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A6NL46 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A6NL46 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A6NL46 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A6NL46 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A6NL46 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A6NL46 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A6NL46 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A6NL46 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A6NL46 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A6NL46 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NL46 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NL46 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NL46 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NL46 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NL46 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NL46 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NL46 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NL46 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NL46 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NL46 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NL46 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NL46 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NL46 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NL46 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NL46 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NL46 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NL46 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NL46 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NL46 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NL46 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NL46 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NL46 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NL46 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NL46 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NL46 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NL46 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NL46 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NL46 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NL46 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NL46 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NL46 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NL46 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NL46 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NL46 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NL46 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NL46 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NL46 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NL46 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NL46 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NL46 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NL46 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NL46 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NL46 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NL46 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NL46 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NL46 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NL46 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NL46 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NL46 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NL46 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NL46 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NL46 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NL46 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NL46 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NL46 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NL46 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NL46 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NL46 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NL46 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NL46 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NL46 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NL46 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NL46 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NL46 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NL46 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NL46 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NL46 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NL46 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NL46 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NL46 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NL46 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NL46 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NL46 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NL46 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NL46 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NL46 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NL46 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NL46 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NL46 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NL46 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NL46 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NL46 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NL46 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NL46 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NL46 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NL46 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NL46 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.7 ms