Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms