Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AFG3L2Q9Y4W6 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AFG3L2Q9Y4W6 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AFG3L2Q9Y4W6 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AFG3L2Q9Y4W6 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms