Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms