Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms