Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms