Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKIRAS1Q9NYS0 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKIRAS1Q9NYS0 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKIRAS1Q9NYS0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKIRAS1Q9NYS0 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKIRAS1Q9NYS0 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKIRAS1Q9NYS0 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKIRAS1Q9NYS0 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKIRAS1Q9NYS0 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKIRAS1Q9NYS0 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS1Q9NYS0 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS1Q9NYS0 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS1Q9NYS0 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS1Q9NYS0 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS1Q9NYS0 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS1Q9NYS0 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS1Q9NYS0 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS1Q9NYS0 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS1Q9NYS0 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS1Q9NYS0 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS1Q9NYS0 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS1Q9NYS0 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS1Q9NYS0 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS1Q9NYS0 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS1Q9NYS0 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS1Q9NYS0 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS1Q9NYS0 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS1Q9NYS0 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS1Q9NYS0 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS1Q9NYS0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS1Q9NYS0 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS1Q9NYS0 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS1Q9NYS0 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS1Q9NYS0 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS1Q9NYS0 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS1Q9NYS0 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS1Q9NYS0 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS1Q9NYS0 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS1Q9NYS0 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms