Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC10Q9NYD6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC10Q9NYD6 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC10Q9NYD6 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC10Q9NYD6 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC10Q9NYD6 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC10Q9NYD6 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC10Q9NYD6 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC10Q9NYD6 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC10Q9NYD6 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC10Q9NYD6 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC10Q9NYD6 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC10Q9NYD6 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC10Q9NYD6 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC10Q9NYD6 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC10Q9NYD6 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC10Q9NYD6 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC10Q9NYD6 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC10Q9NYD6 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC10Q9NYD6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC10Q9NYD6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC10Q9NYD6 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC10Q9NYD6 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC10Q9NYD6 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC10Q9NYD6 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC10Q9NYD6 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC10Q9NYD6 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC10Q9NYD6 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC10Q9NYD6 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC10Q9NYD6 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC10Q9NYD6 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC10Q9NYD6 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC10Q9NYD6 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC10Q9NYD6 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC10Q9NYD6 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC10Q9NYD6 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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HOXC10Q9NYD6 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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HOXC10Q9NYD6 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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HOXC10Q9NYD6 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC10Q9NYD6 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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