Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms