Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMTM6Q9NX76 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMTM6Q9NX76 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMTM6Q9NX76 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CMTM6Q9NX76 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMTM6Q9NX76 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMTM6Q9NX76 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMTM6Q9NX76 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMTM6Q9NX76 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMTM6Q9NX76 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMTM6Q9NX76 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMTM6Q9NX76 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMTM6Q9NX76 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CMTM6Q9NX76 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CMTM6Q9NX76 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CMTM6Q9NX76 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CMTM6Q9NX76 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CMTM6Q9NX76 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CMTM6Q9NX76 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CMTM6Q9NX76 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CMTM6Q9NX76 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CMTM6Q9NX76 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CMTM6Q9NX76 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CMTM6Q9NX76 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CMTM6Q9NX76 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM6Q9NX76 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms