Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATG3Q9NT62 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms