Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
POLR2J2Q9GZM3 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms