Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms