Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CHMP4AQ9BY43 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHMP4AQ9BY43 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHMP4AQ9BY43 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHMP4AQ9BY43 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHMP4AQ9BY43 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHMP4AQ9BY43 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHMP4AQ9BY43 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHMP4AQ9BY43 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHMP4AQ9BY43 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHMP4AQ9BY43 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHMP4AQ9BY43 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms