Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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RAB11FIP5Q9BXF6 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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RAB11FIP5Q9BXF6 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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RAB11FIP5Q9BXF6 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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RAB11FIP5Q9BXF6 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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RAB11FIP5Q9BXF6 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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RAB11FIP5Q9BXF6 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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