Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC94Q9BW85 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms