Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFJQ9BTM1 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms