Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms