Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms