Protein–RNA interactions for Protein: Q99996

AKAP9, A-kinase anchor protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 3,911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP9Q99996 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
AKAP9Q99996 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
AKAP9Q99996 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AKAP9Q99996 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AKAP9Q99996 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
AKAP9Q99996 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AKAP9Q99996 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AKAP9Q99996 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
AKAP9Q99996 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AKAP9Q99996 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AKAP9Q99996 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
AKAP9Q99996 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AKAP9Q99996 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
AKAP9Q99996 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
AKAP9Q99996 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AKAP9Q99996 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AKAP9Q99996 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
AKAP9Q99996 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
AKAP9Q99996 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
AKAP9Q99996 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
AKAP9Q99996 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AKAP9Q99996 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AKAP9Q99996 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
AKAP9Q99996 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
AKAP9Q99996 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
AKAP9Q99996 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
AKAP9Q99996 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
AKAP9Q99996 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
AKAP9Q99996 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
AKAP9Q99996 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
AKAP9Q99996 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
AKAP9Q99996 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
AKAP9Q99996 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
AKAP9Q99996 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
AKAP9Q99996 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
AKAP9Q99996 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms