Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms