Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms