Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms