Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms