Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NKD1Q969G9 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NKD1Q969G9 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
NKD1Q969G9 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NKD1Q969G9 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NKD1Q969G9 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NKD1Q969G9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NKD1Q969G9 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NKD1Q969G9 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NKD1Q969G9 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKD1Q969G9 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKD1Q969G9 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKD1Q969G9 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKD1Q969G9 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
NKD1Q969G9 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NKD1Q969G9 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NKD1Q969G9 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NKD1Q969G9 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NKD1Q969G9 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NKD1Q969G9 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NKD1Q969G9 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NKD1Q969G9 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NKD1Q969G9 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKD1Q969G9 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NKD1Q969G9 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NKD1Q969G9 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NKD1Q969G9 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NKD1Q969G9 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NKD1Q969G9 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKD1Q969G9 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NKD1Q969G9 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NKD1Q969G9 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKD1Q969G9 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKD1Q969G9 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NKD1Q969G9 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKD1Q969G9 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKD1Q969G9 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NKD1Q969G9 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKD1Q969G9 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NKD1Q969G9 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NKD1Q969G9 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NKD1Q969G9 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NKD1Q969G9 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKD1Q969G9 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKD1Q969G9 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKD1Q969G9 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKD1Q969G9 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKD1Q969G9 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms