Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
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GTF3C6Q969F1 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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GTF3C6Q969F1 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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GTF3C6Q969F1 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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GTF3C6Q969F1 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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GTF3C6Q969F1 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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GTF3C6Q969F1 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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GTF3C6Q969F1 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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GTF3C6Q969F1 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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GTF3C6Q969F1 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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