Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHMTQ93088 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms