Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSRNP3Q8WYN3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms