Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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