Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms