Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZIC4Q8N9L1 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZIC4Q8N9L1 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZIC4Q8N9L1 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZIC4Q8N9L1 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZIC4Q8N9L1 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZIC4Q8N9L1 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZIC4Q8N9L1 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZIC4Q8N9L1 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZIC4Q8N9L1 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZIC4Q8N9L1 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZIC4Q8N9L1 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZIC4Q8N9L1 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZIC4Q8N9L1 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZIC4Q8N9L1 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZIC4Q8N9L1 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZIC4Q8N9L1 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZIC4Q8N9L1 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZIC4Q8N9L1 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZIC4Q8N9L1 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZIC4Q8N9L1 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZIC4Q8N9L1 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZIC4Q8N9L1 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZIC4Q8N9L1 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZIC4Q8N9L1 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZIC4Q8N9L1 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ZIC4Q8N9L1 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZIC4Q8N9L1 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ZIC4Q8N9L1 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZIC4Q8N9L1 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZIC4Q8N9L1 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZIC4Q8N9L1 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZIC4Q8N9L1 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZIC4Q8N9L1 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZIC4Q8N9L1 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms