Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GCSAMQ8N6F7 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms