Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C8

LILRA3, Leukocyte immunoglobulin-like receptor subfamily A member 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LILRA3Q8N6C8 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LILRA3Q8N6C8 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms