Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTW8

OTOA, Otoancorin, humanhuman

Predictions only

Length 1,153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOAQ7RTW8 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOAQ7RTW8 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOAQ7RTW8 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOAQ7RTW8 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOAQ7RTW8 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOAQ7RTW8 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOAQ7RTW8 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOAQ7RTW8 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOAQ7RTW8 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOAQ7RTW8 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOAQ7RTW8 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOAQ7RTW8 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOAQ7RTW8 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOAQ7RTW8 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOAQ7RTW8 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOAQ7RTW8 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOAQ7RTW8 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOAQ7RTW8 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOAQ7RTW8 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOAQ7RTW8 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOAQ7RTW8 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOAQ7RTW8 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOAQ7RTW8 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOAQ7RTW8 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOAQ7RTW8 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOAQ7RTW8 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOAQ7RTW8 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOAQ7RTW8 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOAQ7RTW8 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOAQ7RTW8 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOAQ7RTW8 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOAQ7RTW8 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOAQ7RTW8 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOAQ7RTW8 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTOAQ7RTW8 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OTOAQ7RTW8 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
OTOAQ7RTW8 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OTOAQ7RTW8 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OTOAQ7RTW8 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
OTOAQ7RTW8 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OTOAQ7RTW8 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTOAQ7RTW8 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms