Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6P435 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q6P435 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q6P435 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q6P435 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q6P435 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q6P435 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q6P435 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q6P435 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q6P435 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q6P435 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q6P435 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q6P435 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q6P435 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q6P435 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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