Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms