Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ89

DENND4C, DENN domain-containing protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND4CQ5VZ89 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DENND4CQ5VZ89 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms